芯片推薦：Genome-Wide Human SNP Array 6.0
芯片介紹：Affymetrix Genome-Wide Human SNP 6.0芯片產品涵蓋超過1,800,000個遺傳變異標志物：包括超過906,600個SNP和超過946,000個用于檢測拷貝數變化（CNV, Copy Number Variation）的探針:

• 482,000個SNP來自于前代產品500K和SNP5.0芯片；
• 424,000個SNP包括國際HapMap計劃中的標簽SNP，X，Y染色體和線粒體上具有代表性的SNP,以及來自于重組熱點區域和500K芯片設計完成后新加入dbSNP數據庫的SNP；
• 202,000個用于檢測5,677個已知拷貝數變異區域的探針，這些區域來源于多基因組變異體數據庫。該數據庫中3,182個非重疊片斷區域平均用61個探針來檢測；
• 744,000個探針平均分配到整個基因組上，用來發現未知的拷貝數變異區域。

Affymetrix SNP6.0 芯片物理覆蓋度

芯片推薦：Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

芯片介紹：這款芯片與Human SNP 6.0 芯片類似，既包含SNP探針，也包含CNV探針。一共涵蓋623,000個SNP和916,000個CNV位點。

SBC也可為您提供以下物種的Affymetrix SNP芯片服務：犬、稻、生菜、胡椒、擬南芥、玫瑰、草莓、鱒魚

基于GeneTitan平臺的Axiom基因分型芯片
Affymetrix Axiom平臺支持全基因組關聯和候選基因關聯相關研究。研究者將不再受困于固定內容的芯片，全新的基因分型平臺采用酶介導、單堿基測序步驟來確保實驗的低成本、分型結果的高重復性和流程的全自動化。該產品參照HapMap和千人基因組計劃(1KGP)數據庫設計探針，與GeneTitanTM配套使用。

芯片推薦：Axiom® Biobank Genotyping Arrays
芯片介紹：能經濟地對大樣品集合進行基因分型，如生物樣本庫、基因組中心及核心實驗室篩查的樣品。芯片有目錄版本和定制版本可供選擇。

• 功能強大、適合主要人類族群的高覆蓋度分析的全基因組關聯研究（GWAS）分型模塊；
• 適合外顯子組分析Axiom® Exome外顯子分型模塊；
•  吸收、分布、代謝和排泄(absorption, distribution, metabolism, and excretion ,ADME)及其他臨床相關的標記；
•  新發現的功能喪失變異，包括最近外顯子組測序項目中發現的序列插入和缺失。

芯片推薦：Axiom® miRNA Target Site Genotyping Arrays
芯片介紹：一款人類全基因組范圍評估miRNA靶基因位點的高密度基因分型工具。該芯片可檢測在miRNA級聯放大反應中影響基因功能的238,000個SNP和插入缺失位點，包括miRNA、它們的mRNA靶基因位點以及沉默機制相關的位點。其中80%的位點是在其他相關基因分型芯片上所沒有的。因此也可以用它來補充一些GWAS研究和基因調控相關的研究

芯片推薦：Axiom® Genome-Wide Population-Optimized Human Arrays
芯片介紹：最大限度覆蓋不同人種的稀有和常見變異，關注與疾病密切相關以及功能相關的SNP，包含Axiom®中國人基因分型芯片(CHB 1和CHB 2)。

芯片推薦：人 Axiom® Exome Genotyping Arrays
芯片介紹：最完整的外顯子組基因分型芯片，可篩查功能變異，有助于更好的發現新的人類編碼區SNP以及插入缺失。

芯片推薦：牛 Axiom® Genome-Wide BOS 1 Bovine Array
芯片介紹：此款芯片是與牛基因分型領域的重要科學家合作開發的，實現了準確的遺傳價值評估、全基因組關聯研究(GWAS)、生物多樣性和連鎖不平衡（LD）研究。此芯片旨在最大限度提高Bos taurus和Bos indicus品種的遺傳和物理SNP覆蓋度。芯片超過640,000個SNP標記，代表了來自Affymetrix牛基因組數據庫的大約300萬個SNP的遺傳多樣性。

芯片推薦：水牛 Axiom® Buffalo Genotyping Array
芯片介紹：Axiom® Buffalo Genotyping Array帶來了多個物種和品系的水牛（Bubalus bubalis bubalis和Bubalus bubalis carabanensis）中多態性SNP的最高全基因組范圍覆蓋，這些水牛是意大利、巴西和南亞最重要的肉牛和奶牛之一。此芯片是目前市場上唯一一款高密度的水牛基因分型工具，含有90,000個常見和稀有標記。。

芯片推薦：雞 Axiom® Genome-Wide Chicken Genotyping Array
芯片介紹：此芯片是第一款商業化的高密度雞基因分型芯片。此芯片包含580,000常見和稀有的變異標記，這些標記存在于商業的蛋雞和肉雞以及非商業的遠交群中。它適用于蛋雞和肉雞的基因組選擇研究、全基因組關聯研究、高分辨率遺傳圖譜、孟德爾性狀作圖及選擇進化研究。

芯片推薦：玉米 Axiom® Maize Genotyping Array
芯片介紹：玉米是一個二倍體物種（n=10），其基因組大小為2.5Gb。不同品種的玉米基因組表現出重復DNA和高的基因組與結構多樣性。玉米還表現出50-300bp的極低連鎖不平衡（LD），從而需要非常高密度的芯片來研究單倍型結構和基因組多樣性。Axiom Maize Genotyping Array帶來了極高密度的（600K）全基因組SNP覆蓋。這些多態性SNP在285個硬粒型（Flint）和馬齒型（Dent）玉米中檢測到，代表了161個來自世界各地的不同品種。

芯片推薦：三文魚 Axiom® Salmon Genotyping Array
芯片介紹：此款芯片由Affymetrix聯合蘇格蘭的科學家共同開發，包含130,000個SNP標記。芯片上的高密度標記確保了三文魚基因組的廣泛覆蓋，又避免了重要區域的代表性不足。此芯片適用于三文魚復雜性狀研究、分子育種、選擇進化研究。

芯片推薦：大豆 Axiom® Soybean Genotyping Array
芯片介紹：此款芯片也稱為Axiom® SoyaSNP 96-Array Plate，共包括180,961個標記，適用于對栽培和野生的大豆品種進行基因分型。它是全基因組關聯研究和高密度遺傳作圖的理想選擇，可確定野生及栽培大豆種質中的重要適應性基因。

芯片推薦：小麥 Axiom Wheat HD Genotyping Array &Breeder’s Genotyping Array
芯片介紹：小麥的基因分型芯片是通過Affymetrix專家設計項目與英國布里斯托大學合同設計的。芯片有兩種：高密度（HD）的芯片包含817,000個SNP位點，而Breeder’s基因分型芯片包含35,000個SNP位點。這些芯片上的標記都可以在CerealsDB網站（http://www.cerealsdb.uk.net/）上查詢。

SBC也可協助研究者根據實驗需求，定制Axiom® myDesign? Genotyping Arrays。 

服務相關(以Affymetrix SNP6.0芯片為例)

樣品要求

1.樣品純度：OD 260/280值應在1.7～2.0 之間, A260/A230 > 1.5；RNA 應該去除干凈；不含有其它個體或其它物種的DNA污染。
2.樣品濃度：濃度不低于55ng/μl；
3.樣品總量：每個樣品總量不少于2μg 。
4樣品溶劑：溶解在Reduced TE (10mM Tris, pH 8,0，0.1mM EDTA)中。
5.樣品運輸： DNA低溫運輸（-20℃）；在運輸過程中請用parafilm將管口密封好，以防出現污染；

服務流程

數據分析

單位介紹

•        上海伯豪生物技術有限公司（Shanghai Biotechnology Corporation）是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心根據國內外研發外包發展的需要，整合旗下系統技術平臺、商業化服務體系、高素質服務團隊等資源成立的致力于研發外包服務的專業化公司。

  上海伯豪生物技術有限公司擁有六大服務平臺：生物樣品分析平臺、微陣列芯片平臺、新一代測序平臺、生物標志物平臺、分子檢測平臺、生物信息平臺，憑借高標準的技術平臺和多樣化的服務等競爭優勢，公司向國內外企業和相關單位提供系統的生物學研究全面解決方案。目前正在為多達18家跨國制藥企業（包括排名前10位的跨國制藥企業）和超過3000家的國內科研機構、醫院等提供基因表達譜、基因分型、比較基因組學、DNA甲基化、miRNA、生物標志物篩選及確認、生物信息等技術服務。 

  公司擁有一支以上海為基礎，輻射全國的強大市場營銷隊伍和銷售網絡，已設立華北、華南、華東三個大區十五個辦事處，推廣公司的主導技術服務、代理產品，快速提升公司品牌的知名度，擴大影響力。過去10年承接項目數超過10000個，用戶單位3000家以上，協助客戶發表SCI論文700余篇（影響因子共計3000多分），全面推動了中國基因組學服務產業的發展。 

  公司建立了規模化的質量控制體系，通過了ISO9001: 2008質量技術體系的認證，并參照GLP-L的標準，通過128個SOP文件對項目、樣品、實驗過程、生物信息分析過程、數據信息管理、保密等進行嚴格質控。尤其是數據管理，做到異地備份，保密管理。為用戶的數據真實性、可靠性提供了保證。

  公司的系統化技術平臺和高質量的服務體系得到了廣大客戶認可和合作伙伴的高度評價。公司平臺陸續獲得了國際知名高通量技術廠商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技術服務中心認證。公司于2012年獲得諾華（CNIBR）優秀供應商獎（Supplier Award 2012）。公司是Affymetrix公司在中國第一家認證的服務提供商，是Agilent公司在國內唯一認證的服務提供商，先后被授予“Agilent公司亞太區最佳服務供應商”和“Affymetrix公司優秀服務商”稱號。

  
  

單位資質

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